Naruto gizli bir ninja kasabası olan Konohagakure'ye saldıran cehennemin iblislerinden Kyuubi'yi durdurmak için, Onu yeni doğmuş bir çocuk olan Naruto'nun içine mühürler. Böylece kahramınımız Naruto ortaya çıkmıştır.İçine gizlenen şeytan sebebiyle kasaba ahalisinin kinini kazanan Naruto daha bebekken yetim kalmış biridir. Kasaba halkınında kendini dışlamasıylada oldukça yaramaz ve haylaz biri çocuk olur. Fakat ninja akademisinden mezun olacağı gün, hayatında ilk defa olarak arkadaş edinmesi Naruto'nun hayatını bütünüyle değiştirir.